产品介绍
由中国有水产品科学学研发院怪物方法研发心中李炯棠研发团体整合与长沙康普森农林科技发展有效集团公司開發了一种适用于鲤培育、蔬菜品种技术工艺鉴定等经常功用的什么是基因生物育种存储存储芯片
——“鲤育壹号”(图2)。该存储存储芯片包括了20K个高品水平的SNP位点,为大桂鱼财产提质增强药效,培育良好、优良品种、耐粗、高抗、耐密等比较好遗传性状的大桂鱼优种出示重要的方法撑起、。
“鲤育六号”进行康普森CAGT(®)靶点捕捉到测序科技,具有16种主养青鱼的全什么是表观遗传组重测序进化和重点经济发展遗传特性关系标出。“鲤育六号”电源电源处理器位点复盖全什么是表观遗传组选购生物生物育种不确定义大的位点和归属于多种类青鱼年龄层多态性标出。该电源电源处理器具有青鱼营养物质茶叶品质遗传特性(粗淀粉酶、粗皮下健身肌肉、核苷酸、皮下健身肌肉酸、健身肌肉质构、肌间刺、纹段等)、外周血成份及含量、宝宝血型等遗传特性的分子结构标出18056个,除此以外还是指分辩16种鲤蔬菜茶叶品类特男人位点144个,可用来重点遗传特性的生物生物育种值估测和蔬菜茶叶品类确权保障。进行样本量量电源电源处理器测试方法,“鲤育六号”电源电源处理器,產品位点查出率高,最低值查出率达到了了95.18%,產品维持性好、什么是表观遗传型精准高,重叠样本量量最低值分型相符率有98.77%,產品性能方面优秀企业。
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物品信息
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核心主要参数
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“鲤育二号”繁育电子器件
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图标个人信息
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标记符号款式
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SNP
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标出数
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20359
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鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 性别等性状功能位点
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18056
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优良品种签别位点
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144
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枝术分类
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康普森CAGT®靶向治疗阻止测序高技术
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关联性基因组组
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GCF_018340385.1
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数据表现
“鲤育一号”— 染色体分布情况
鲤鱼(Cyprinus carpio)作为异源四倍体鱼类,各由25条染色体组成。该芯片囊括了A亚基因组和B亚基因组的鲤亚基因组水平的变异,为在四倍体背景下开展重要经济性状遗传解析,进行基因组选择育种技术创新提供了新的视野。
图1 芯片位点在染色体上(A基因组和B基因组)的分布图
“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布
图2 芯片位点MAF分布
“鲤育一号”育种芯片 — 位点注释情况
图3 芯片位点注释情况
“鲤育一号”育种芯片 — 分型一致性
图4 重复样本分型一致性
通过对3组重复样本进行分型,显示平均一致率达98.77%。
以上结果表明,鲤育一号位点选择合理、变异丰富、一芯多用(育种、品种鉴定、功能位点因果检测),芯片设计出众,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。