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产品介绍
中国有鱼业科学学科研院珠江鱼业科研所赵建科研员专业团体与苏州康普森林业科枝现有公司的联和開發了几款适于乌鳢的靶向疗法猎取繁育基带单片机IC芯片 ——“乌鳢50K繁育基带单片机IC芯片”。该基带单片机IC芯片是指了50K个高品品质的SNPs位点,分为了与男女有关于的功能模块位点,可应用于乌鳢全表观遗传组挑选繁育、新品发布种培肓、群体心理家系搭配及系谱判定等基础条件科研。
商品内容 首要数据 乌鳢50K生物育种存储芯片
标识产品信息 标出型号 SNP
标示总额 50000
性取向各种相关位点 230
技術形式 康普森CAGT®靶点获取测序技木
测序客户群体 福建、浙江省、河南、陕西、杭州、杭州、石家庄、吉林等省市乌鳢或是白乌鳢、金乌鳢
符合表观遗传组 GCA_033026475.1
应用方向
育种保种应用
全基因组选择育种
新品种培育
群体家系构建及系谱鉴定
基础研究
全基因组关联分析
选择信号分析
群体遗传进化分析
种质资源评估
数据表现
乌鳢50K育种芯片 — 染色体分布情况

图1 芯片位点在染色体上的分布图
乌鳢50K育种芯片 — MAF分布

图2 芯片位点MAF分布
乌鳢50K育种芯片 — 位点注释情况

图3 芯片位点注释情况

乌鳢50K育种芯片 — PCA比较分析

下图为根据群体原始基因型获得的PCA(左图),下图为根据芯片SNP位点获得的PCA(右图),样本聚集情况在二者中表现基本一致,说明该芯片可较好地代表群体原始状况。