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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全dna组低进一步重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是巧用较低进一步(~1×)的重测序数据统计报告库做好遗传基因病突变分析,最后依据dna型充实,将低体积高密集度数据统计报告库充实为高体积高密集度dna型数据统计报告库。LcWGS 免系統研发,测序资金低,能抓取全dna组遗传基因病突变,更影响于大企业规模样品的遗传性状位置定位及 GS 繁育应该用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可兑换全什么是基因组的遗传性基因变异
  • 高性价比
    以超低的测序料工费低,得到 高体积密度的箭头,监测学习工作效率更高
  • 大群体
    样本检测
    应采用大客户群体的表观遗传型检验及探索
  • 分型
    准确性高
    系统设计自动填充优化算法,基因分型正确率多达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS相对性状地位及GS最终结果相当
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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