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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全隔代遗传什么是基因组隔代遗传病组低进一步重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是采用较低进一步（~1×）的重测序统计资料做隔代遗传病隔代遗传变种临床表现，接下来顺利通过隔代遗传什么是基因组隔代遗传病型充填，将低高密度高统计资料充填为高高密度高隔代遗传什么是基因组隔代遗传病型统计资料。LcWGS 不可控制系统建设，测序投资费用低，也可以修改全隔代遗传什么是基因组隔代遗传病组隔代遗传病隔代遗传变种，更极为有利的于规模化化模本的特性确定及 GS 生物育种利用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可刷出全DNA组的隔代遗传遗传变异
  • 高性价比
    以超低的测序成本投入低，得到密度高的计算的符号，探测利用率高
  • 大群体
    样本检测
    适合于大归类的染色体型的检测及研究方案
  • 分型
    准确性高
    立于自动填充java算法，临床诊断准确的率相当于98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质产品定位及GS结局比效
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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