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乌鳢
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产品介绍
华人海产品小学科学钻研院珠江海产品钻研所赵建钻研员精英团队与深圳康普森草业现代科技有限单位单位联办开发设计了这款比较合适于乌鳢的靶点驯服生物繁育基带电子器件 ——“乌鳢50K生物繁育基带电子器件”。该基带电子器件蕴含了50K个高效率量的SNPs位点,区域了与性别角色有关的的性能位点,适使用在于乌鳢全遗传基因组选购生物繁育、产明细培植、客户群体家系建设及系谱签别等知识基础钻研。
软件资讯 重要的主要参数 乌鳢50K选育单片机芯片
标志消息 标上类形 SNP
标注数量统计 50000
男女关联位点 230
技巧类型、 康普森CAGT®靶向疗法阻止测序技术工艺
测序社会群体 兰州 、河北、浙江、上海市、山东、河北、重庆、甘肃等省份乌鳢已经白乌鳢、金乌鳢
参考价值DNA组 GCA_033026475.1
应用方向
育种保种应用
全基因组选择育种
新品种培育
群体家系构建及系谱鉴定
基础研究
全基因组关联分析
选择信号分析
群体遗传进化分析
种质资源评估
数据表现
乌鳢50K育种芯片 — 染色体分布情况

图1 芯片位点在染色体上的分布图
乌鳢50K育种芯片 — MAF分布

图2 芯片位点MAF分布
乌鳢50K育种芯片 — 位点注释情况

图3 芯片位点注释情况

乌鳢50K育种芯片 — PCA比较分析

下图为根据群体原始基因型获得的PCA(左图),下图为根据芯片SNP位点获得的PCA(右图),样本聚集情况在二者中表现基本一致,说明该芯片可较好地代表群体原始状况。